W gamie rodziny Audi Q6 e-tron znalazły się dwa warianty: podstawowy SUV Q6 e-tron oraz usportowiona odmiana SQ6 e-tron.

W styczniu 2025 rodzina modelu powieksza się o nowe odmiany Q6 e-tron Sportback/SQ6 e-tron Sportback.